
本公司可提供各种动物模型的制作,主要涉及以下几个方面:
1 小鼠肿瘤模型 主要为裸鼠及其它普通小鼠的移植性肿瘤动物模型制作
2 心血管系统疾病模型 心肌缺血及再灌注、心梗、血压测定(麻醉及清醒状态下)、抗血栓等
3 糖尿病疾病模型 STZ诱导的糖尿病模型及糖尿病药物筛选
4 抗肥胖药物筛选模型 大麻素CB1受体拮抗剂——食欲控制
5 神经系统疾病模型 镇静、镇痛动物模型行相关的行为学模型制作及药物筛选
6 高通量筛选模型
7 骨质疏松症模型 切除卵巢/睾丸致骨质疏松
8 肝脏疾病模型 急性肝损伤模型及脂肪肝模型
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上海丰核信息科技有限公司,是由上海交通大学教授及其实验室团队联合具有丰富企业管理运营的职业经理人创建的一家专注于生物信息学分析的高科技创新型企业。丰核信息团队核心成员由上海交通大学,香港大学,美国贝勒医学院,华东师范大学的生物信息学高学历人才组成。公司已经建成并完善了流程化的智能网络分析平台以及文本挖掘系统平台并申请了相关专利。
公司致力于为生命科学领域研究者提供专业的生物信息学服务,主营业务包括个性化科研目为导向的数据挖掘,算法开发,高通量生物学芯片数据分析,数据库开发以及基于生物信息学分析探路的实验路线设计,实验外包,结果分析以及SCI论文修改等服务。
基金申请服务
1科研工作者申请科研基金的过程中缺少科研基础,或者是为研究方向没有坚实的研究基础,是科研基金申请失败的重要原因。
2科研工作者第一次申请科研基金,将会在申请过程中遇到种种困惑和陷阱。怎样选题,标题怎么写,投放那些学科,创新性如何体现,种种问题让写基金的科研工作者功败垂成,只有寄希望于不断的努力。
解决方案:
1 MicroSCI以客户的研究方向为导向,综合运用生物信息学技术方法预测可能结果。结果报告可放入基金申请的标书的立项依据部分,让您的研究更加有理有据。
2 MicroSCI拥有强大的科研申请基金专家团队,在自己的科研和学习工作中积累了丰富的经验和资料。欢迎您来信索取有关免费资料。
原理
客户提供研究方向关键词(基因名称,疾病名称或其他信息),microSCI使用计算机文献挖掘的方法挖掘文献数据库中对关键词进行描述的信息,然后对客户自己拥有芯片或者是公共数据库中已有芯片进行深入挖掘,进行后续的转录调控网络构建,蛋白质相互作用网络构建,信号通路分析,基因功能富集分析,并且预测潜在和疾病有关的基因,从而后续研究提供了研究方向和指导建议。
意义
1、深入挖掘客户的芯片结果,提升发表文章的档次。
2、验证芯片结果可靠性。
3、通过构建基因调控网络,可以从转录调控角度揭示基因之间的相互作用。
4、进行信号通路有关的分析,可以寻找疾病的有关的重要信号通路。
5、总体了解把握研究方向并且寻找和现有研究方向有关的新的热点和创新点,可以运用于基金申请的项目立项,研究背景以及科研论文综述类写作方面。
分析实例
文献挖掘结合芯片挖掘预测潜在疾病有关基因
项目概述:
客户提供关键词“肺癌”和“甲基化”2组关键词,我们帮助客户找出已经研究证实的肺癌甲基化有关的基因,并结合甲基化的芯片进行分析预测哪些基因可能通过甲基化的方式在肺癌的发生发展中起作用。
分析方法:
1 利用关键词搜索文献数据库获得所有肺癌甲基化相关的文献。
2 利用计算机文献挖掘的方法对文献进行挖掘,找到相肺癌甲基化相关的所有基因/蛋白。
3 从公共数据库中寻找芯片数据或者是客户自行提供其芯片数据。
4 使用meta分析的方法整合芯片数据,寻找芯片甲基化有关基因。
5 根据蛋白质相互作用关系构建已有文献挖掘基因集合和甲基化基因集合的关系。
6 通过整合文献挖掘结果,转录调控数据,蛋白-蛋白相互作用,基因融合等数据,建立一个肺癌相关的小分子相互作用的调控网络。
7 分析网络,得到潜在的可能和肺癌发生发展有关的基因。
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概述
全基因组全新测序(de novosequencing)不需要任何参考序列即可对某个物种进行测序,用生物信息学分析方法对测序序列进行拼接组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。通过基因组测序是快速了解物种的重要途径,可加深对所测物种生长、发育、进化、起源等重大问题的认识。自成立以来,CHGCS先后承担和参与了人类基因组测序、水稻4号染色体测序、黑猩猩22号染色体测序、日本血吸虫基因组测序等多个重大项目,研究成果发表于Nature、Science、Nature Genetics、PNAS等众多国际权威学术期刊。
测序策略
估计基因组大小,能否提供单倍体;
需要100ug左右的DNA;
进行ITS和16s检测,确保物种正确及没有细菌污染;
初步测序:先用solexa做30-50倍覆盖率的300bp文库的Paired-end测序,拼装后评估基因组大小及杂合度;
深度测序:solexa测3个Paired-end库(170bp,300bp和500bp),做到100倍覆盖率;至少用454做2倍覆盖率;
框架图:在上述测序拼装的基础上,加测100倍覆盖率的solexa Mate-pair文库(3kb,8kb和20kb);
如果是复杂基因组,需要构建BAC文库,基于BAC末端测序结果进行全长测序。
参与的项目及研究成果
人类基因组计划:3号染色体短臂近着丝粒区,29BAC,3.35Mb序列
水稻(粳稻)4号染色体精细图:112BAC,10Mb序列
黑猩猩22号染色体测序:40BAC,5Mb序列
日本血吸虫基因组测序
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上海迈程医疗器械有限公司
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