Small RNA(micro RNAs、siRNAs和 pi RNAs等)是指总RNA中长度在18-30nt的RNA分子,是一类高度保守的小RNA分子,其作为生命活动中重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Illumina能够对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。通过Illumina对Small RNA大规模测序分析,可一次性获得物种全基因组范围内的全部small RNA信息,从而能够绘制全基因组水平的miRNA图谱,实现包括新miRNA分子的挖掘,其作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学应用。