微生物多样性分析

环境微生物多样性检测，是以样品中的微生物群落作为整体进行研究，通过对核糖体RNA高变区域（比如16S/18S/ITS等序列）或功能基因（如古菌的氨氧化基因等）进行PCR扩增和测序，然后分析相应环境下微生物群落的多样性和分布规律，对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。

16S rDNA：编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和可变区，保守区反映生物物种间的亲缘关系，可变区反映物种间的差异。

18S rDNA：编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和可变区。保守区反映生物物种间的亲缘关系，可变区反映物种间的差异。

ITS1/ITS2：ITS1位于真核生物核糖体 rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于真核生物核糖体 rDNA 序列5.8S和28S之间。ITS区域进化速率是18S rDNA的10倍之多。