细菌具有5S, 16S, 23S三种rRNA,其中5S rRNA序列较短,包含的细菌遗传信息量少,不适合用于分析鉴定细菌种类,而23S rRNA序列较长,且碱基突变速率要比16S rRNA快得多,不适用对较远亲缘关系的细菌进行鉴定。16S rRNA其大小约1500 bp ,所代表的细菌遗传信息量适中,是进行细菌分类研究的理想材料。
细菌16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA的DNA序列,存在于所有细菌染色体基因中,它由保守区序列及可变区序列两部分组成。细菌16S rDNA的可变区序列能够显示细菌间不同分类等级水平上的特异性,适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究,并可作为测量细菌进化和亲缘关系的良好工具,同时可以利用可变区序列的差异对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。
★服务内容:
提取客户提供的细菌菌株基因组总DNA,扩增细菌16S rDNA序列,对细菌16S rDNA序列进行序列测定,分析细菌16S rDNA序列信息,确定客户样品细菌种属关系。
★您需要提供的信息:
1. 试管菌、甘油菌、体积大于500ul的细菌菌液或细菌DNA。
2. 所送样品可能的分类地位、已知生长性状、分离环境条件、所提供的DNA纯度等。
3. 细菌样品是否具有致病性和潜在危险,如您对样品具有一定的致病性或均有潜在的危险,请您提供细菌DNA。
★服务价格
1. 细菌16S rDNA部分序列分析:350元/样品
2. 细菌16S rDNA全序列分析:550元/样品
★服务周期:
30样品以下2-5个工作日内递交结果。如遇到特殊情况,我们会及时与您联系,保证尽早发货。
30样品以上依据具体样品数量而定。
★服务承诺:
我们提供给您细菌样品的测序锋图,序列比对结果及完整的结果分析报告。
★客户须知:
1. 我们的一次性收费包括细菌DNA提取,细菌16S rDNA 序列扩增,扩增产物纯化及16S rDNA序列测序费用。
2. 细菌鉴定服务完成后,相应的菌株为您保存1个月,一月后将统一销毁。
3. 常温运输时间过长会导致菌体老化,细胞壁难以破碎,因此对于试管菌,建议您使用冰袋运输。
4. 如果测序结果出现套峰,视为样品不纯,因实验样品不纯造成的测序套峰,将收取全额实验费用。
5. 我们不接受有致病性菌种的鉴定。