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  • 北京百泰派克生物科技有限公司
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    蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

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    • 发布时间:
      2024-01-17 15:26:04
    • 供  应 商:
      北京百泰派克生物科技有限公司
    • 供应分类:
      CRO服务
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    • 蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定
    
                    

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    百泰派克生物结合MALDI-TOF质谱系统与LC-MS/MS质谱系统,提供专业准确的蛋白胶点、胶条、IP样品,CO-IP样品蛋白鉴定服务。可鉴定的样品包括:1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条,2DE PAGE中的蛋白胶点,蛋白表达产物,免疫共沉淀(Co-IP)样品。其中,蛋白质样品的鉴定前处理过程严格按照Nature Methods发表的文章:Universal sample preparation method for proteome analysis进行,保证鉴定试验中得到更高的肽段覆盖率。质谱鉴定的原理则是基于鸟枪法(Shot-gun):将蛋白条带或者蛋白溶液酶切成肽段混合物,经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分,进入高分辨率质谱仪中进行分析。检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对,结合匹配度打分及错配过滤,可得到肽段的确切序列,进而拼接出各蛋白的完整序列,从而实现对蛋白的鉴定。


    蛋白质质谱鉴定流程


    鸟枪法(shot-gun)LC-MS的蛋白鉴定流程

    基于鸟枪法(shot-gun)LC-MS的蛋白鉴定流程


    关于样品

    1D SDS PAGE /2D PAGE gels样品:


    1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain样品均可进行蛋白的鉴定试验;
    2. 银染的样品有可能与后续的质谱分析不兼容,我们推荐您使用下面的产品或者实验步骤进行银染实验:
    ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)
    Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)
    3. 银染的样品请不要进行脱色处理

    液体样品(In solution format):


    1. 假如样品中蛋白量>10ug,我们对样品的缓冲体系没有要求;
    2. 假如样品中蛋白量<10ug,样品准备过程中尽量减少SDS等表面活性剂的使用,并注意降低盐浓度;
    3. 提交样品过程中,注意提供样品的缓冲体系和样品中蛋白的预估含量;


    Co-IP样品:


    1. 如果您洗脱的样品需要跑胶,请按照1D SDS PAGE样品准备要求准备样品即可;
    2. 如果您直接提交洗脱样品,我们推荐使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 缓冲体系进行蛋白洗脱,保证洗脱缓冲体系与后续的质谱实验兼容;


    样品运输:


    1. 我们推荐您将样品冻干后进行运输,冻干样品中蛋白非常稳定。
    2. 液体样品推荐干冰运输,短途运输冰袋也可以。



    注意事项: 利用质谱进行蛋白样品的鉴定,在样品准备过程中需佩戴手套和头套,尽量避免自身角蛋白(keratin)对样品的污染。


    研究案例

    该项目是中国科学院生物物理所一位老师将她的Co-IP的样品寄给我们进行蛋白鉴定。得到的部分结果如下图所示:

    蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定研究案例

    蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定研究案例


    从图中可以看出,我们提供的结果报告中包含鉴定到的蛋白的Accession Number, Peptide coverage, 鉴定出的肽段信息,鉴定出的肽段的修饰信息以及对鉴定到的蛋白的详细描述。


    中/英文项目报告:

    在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:

    1. 实验步骤(中英文)
    2. 相关的质谱参数(中英文)
    3. 质谱图片
    4. 原始数据
    5. 鉴定的蛋白质详细信息


    蛋白胶点、胶条、IP样品质谱鉴定一站式服务


    您只需下单-寄送样品
    百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告


    相关服务

    蛋白质质谱鉴定
    Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定
    1D SDS-PAGE和IEF服务
    二维凝胶电泳服务
    CO-IP免疫共沉淀法蛋白互作分析


    百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商

    北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack TechnologyCompany Ltd.简称BTP)从事以生物

    质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服

    务。

    1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测测分析服务:

    2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量量研究服务

    3、业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信

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