简介：瑞金特生物实验中心引进美国安捷伦公司的液相色谱质谱联用仪。形成了高通量、高灵敏度和高分辨率的规模化蛋白质分析支撑技术体系，为促进蛋白质组学及相关研究的发展，共享先进的技术资源，近年来生物质谱实验室蛋白质/多肽质谱鉴定、生物工程药物结构确证和蛋白质组学多项成熟的分析技术已为国内外客户提供了广泛的服务。设备仪器：美国安捷伦公司Agilent （xct-6330） 型号的液相色谱仪，MS为美国热电公司的TSQ型号质谱仪；质谱仪采用ESI（电喷雾电离）离子源，MS/MS 串连四极杆分析器。可在线检测极性有机化合物、核酸、多肽、小分子蛋白质及其化学修饰产品的实际分子量，并对送检样品进行分子量鉴定，纯度及修饰效果分析。质量范围M/Z 10～2,000 分辨率R=2M设备应用：芯片/质谱 (HPLC-Chip/MS) ——显著提高了纳流液-质联用分析结果的灵敏度，可靠性和分析速度 安捷伦推出了世界第一台的基于微流控技术的纳流液相色谱芯片-质谱平台。 这项技术将主要用于蛋白质组学和药物分析方面。其核心是采用可重复使用的聚合物液相色谱芯片取代传统的液相色谱柱。这个平台将多维色谱集成在一块芯片上，采用插拔式设计，操作简单与标准液相色谱/质谱联用仪相比， 它的其灵敏度提高了3,500倍。尽管芯片的体积很小，但是可以容纳最长20 厘米的有C18填料的色谱柱。液相色谱/芯片作为一个模块与安捷伦的所有6000系列液-质联用仪完全兼容。 液相色谱-芯片技术主要应用蛋白质组学研究和药物标靶研究等领域。有关 的应用发表在许多国际知名的杂志上，如Analytical Chemistry; Electrophoresis, PNS上液相色谱芯片产品主要包括七种类型的芯片涵盖大分子和小分子的应用：* 酶解蛋白质鉴定芯片 #1 * 酶解蛋白质鉴定芯片#2 * 寡聚糖的芯片 * 直接进样芯片* 小分子芯片 * 质谱校正和诊断芯片 * 全蛋白质分析芯片测试范围：多肽、蛋白质的电喷雾质谱分子量测定以及天然产物分子、生物大分子、有机分子的质谱测试和研究送检样品要求：样品应尽量不含盐份、离子表面活性剂、去垢剂及一些难挥发性盐。样品送检量、溶解方式以及未知可否做质谱检测的样品可与我们的工作人员联系以便提高检测效率。（送样单请附带检测样品的品名及精确计算分子量）送样须知：A：样品量：50pmol干粉或1ug/uL以上（一般测试）、100pmol干粉或1ug/uL以上（MALDI串联质谱分析）、100ug干粉以上（二硫键分析、糖基化分析，磷酸化分析，其他修饰分析）、10ug干粉以上（SDS-PAGE或IEF）；B：盐含量：挥发性无机盐，<20mM，请勿使用PBS、SDS和尿素等质谱干扰物质；C：考马斯亮蓝染色样品可全部接收，银染过程中不得使用戊二醛作为固定剂；D：请告知样品是否有修饰，并请注明修饰方式。主要应用 :* 蛋白质组学研究 * 寡聚糖和糖蛋白的研究 * 小分子化合物分析* 药物发现和研发 * 食品和环境样品分析检测报告：从收到样品起1-2个工作日内可给出样品的检测报告，以电子邮件的形式发给您并附带检测结果分析。包括结果有：一级质谱：质谱图、肽段分子量、数据库检索结果； 二级质谱：质谱图、肽段分子量、数据库检索结果、肽段氨基酸序列、修饰位点等；

提供基于Ion torrent平台的基因检测服务：快速准确地得到多个基因，多个样本的基因突变情况， 为疾病的诊断，治疗提供基因水平的参考意见。。肿瘤基因靶向测序a.  Cancer Hotspot Panel V2：靶向50个原癌及抑癌基因，覆盖约2800个已知外显子突变位点，最高4000 X测序深度。b.  Comprehensive Cancer Panel：靶向409个引用次数最多及突变最频繁的关键原癌及抑癌基因，350 X以上测序深度。c.  BCRA1/2 Panel：特异性针对乳腺癌/宫颈癌BCRA1/2检测，1000 X以上测序深度。Angelina Jolie通过基因诊断降低乳腺癌发病风险引起全球热议。d.  Colon and Lung Cancer Panel：特异性靶向结肠癌、肺癌相关22个基因热点区域，1500 X以上的测序深度。遗传病基因检测:Inherited Disease Panel：涵盖 700多种常见孟德尔遗传病相关的328个基因当基因组位置的测序覆盖度>20x时，生殖细胞系突变检测>90% 神经肌肉疾病涉及237种疾病中88个基因心脏病涉及143种疾病中61个基因发育疾病涉及143种疾病中61个基因代谢疾病涉及44种疾病中28个基因其他典型遗传性疾病涉及196种疾病中75个基因。定制化靶基因测序:我们还可采用Ion AmpliSeq™ Custom Panel：根据研究兴趣设计并定制目的基因的测序服务，可灵活选择测序深度。目前已经给多个医院客户做过多个大型定制化服务。1 微生物多样性测序产品介绍微生物多样性测序（又称扩增子测序）是利用二/三代测序平台，对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序，突破传统微生物不可培养的缺点，获得环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。适用范围医学领域：常见疾病与人体微生物的关系动物领域：瘤胃产甲烷菌类群研究等农业领域：农业耕作等环境领域：雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理等特殊极端环境：气候变化导致的环境变化研究实验流程：：分析流程技术参数样本类型土壤：10 g；粪便：3-5 g；血液：10   mL；污泥：5-10 g；  DNA：总量 ≥ 4 μg、浓度 ≥ 50 ng/μL、1.8 < OD260/280 < 2.0平台选择Illumina   PE250/300、PacBio平台推荐测序量土壤：2-3万；粪便：2-3万；肠粘膜：1-2万；胃液：1-2万；  水样：>1万；沉积物：>1万；皮肤表面：1-2万2. DNA常规测序测序特色a.  取样快高效快捷的专业物流，每天两次取样，保证样品第一时间到达实验室。b.  瑞金特生物测序单序列读长可达800～900bp。c.  瑞金特生物提供的可靠碱基，质量值均在Q20以上。d.  操作精专业的技术人员，严格SOP双重质控，样品数据真实可靠。e.  效率高质粒和已纯化PCR产物，24h出结果，菌和未纯化PCR 产物，36～40h出结果。a.  不怕难瑞金特生物结合自主研发的试剂及BI dGTP BigDye terminator v3.0等昂贵试剂，能有效解决高GC、发夹结构等难题。免费服务根据不同的需求，我们还可以为合作伙伴免费提供：a.  测序引物设计和评估b.  序列拼接c.  DNA序列的基本分析d.   Primer Walking引物设计e.   菌液活化3. EST测序EST（Expressed Sequence Tag）表达序列标签是指随机从构建的cDNA文库中挑选克隆，并进行5'端和3'端一次性测序所获得的短cDNA部分序列，一般长度为150～500bp。虽然EST只是完整基因的一部分，但是其序列长度已足以代表该基因，因此可以采用EST特异性地标记基因。目前，EST的数目比GenBank中其他核苷酸序列多，所以在EST 库中更容易搜寻到新的基因，它已被广泛地应用于基因的识别。另外，由于EST 来源于特定组织在特定环境下总mRNA所构建的cDNA文库，因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。EST测序的应用a.  基因表达谱分析b.  SSR标记的发掘c.  作为构建分子标记连锁图谱的探针生物信息分析1. 基本信息分析a.从峰图到序列的转化，去除低质量的序列和载体序列b.序列拼接c. EST注释d. ORF预测及分析e. 基因注释（NR、NT数据库）2. 高级信息分析a.功能蛋白分析b.Interpro功能域分析c.序列属性及其对应Unigene的分析d. COG分析e. Pathway分析提供结果 1. 测序峰图及序列文件 2. 生物信息分析报告4.小基因组Shotgun测序鸟枪战略（Shotgun Strategy）又称随机测序战略，是由美国塞莱拉遗传公司创始人克雷格·文特尔发明，主要针对大片段的全长测序。此策略是将基因组DNA用机械方法随机打断成小片段，并连入合适的载体构建亚克隆文库，从中随机挑取克隆测序，再通过生物信息学方法对测得的序列进行拼接组装以获得大片段DNA的序列。构建不同插入片段大小的Shotgun文库（1.5～3 Kb、4～6 Kb、6～8 Kb等），可减少因基因组中的重复序列造成的错误拼装，提供更多Contigs之间的关联信息。Shotgun策略已广泛应用于包括基因组、叶绿体、线粒体、野生质粒、噬菌体、病毒以及Fosmid/Cosmid/BAC克隆等的全长测序。优势a.  成熟的Shotgun文库构建体系，确保您在最短时间拿到数据我们曾创造了10个工作日完成40 Kb Fosmid全长测序的记录。b.  专业的生物信息团队:能提供可靠精准的序列拼接结果，8～10倍覆盖率，phred-20质量标准，全长准确率大于99.99%，并可提供专业的生物信息分析。c.  丰富的实战经验:目前已成功完成了包括链霉菌、水稻、番茄、扬子鳄、熊猫、朱鹮等物种的Fosmid/BAC克隆全长测序1000余例，小鼠、蚯蚓、油菜花、大豆等物种的线粒体100余例，大肠杆菌的野生质粒、噬菌体、病毒等全长测序20余例。我们所提供的全长序列已被众多实验室用于发表学术论文。提供结果完整的实验报告（包含实验细节、质控点、数据拼接记录和完整序列）。收费标准5.BAC末端测序细菌人工染色体（Bacterial Artificial Chromosome，BAC）文库的构建是进行基因组研究的一项重要基础性工作，特别是对大基因组及超大基因组生物来说更是如此，在物理作图、基因图位克隆、基因结构和调控等研究中发挥了重要作用。BAC末端测序技术通过测定插入片段两端的序列，能够迅速而精确地进行序列拼装，并确定基因组序列结构的多态性，如倒置和易位等，在基因组全序列测序中有着举足轻重的作用。  BAC末端测序难点  一般来说，BAC测序比质粒或PCR产物的测序要困难得多。主要难点体现在以下几个方面：a.  BAC质粒插入片段长（一般大于100 Kb），容易形成二级结构，而二级结构区域后的DNA链可能会因延伸不够充分而造成测序异常。b.  BAC测序需要毫克级高纯度的DNA，从而获得充足信号，以利于准确的碱基信号检出和最大读长的获得。但是BAC质粒在细菌中为单拷贝或低拷贝，DNA提取和纯化难度很大。c.  测序反应完成后，产物需进行纯化才能上机（ABI3730xl）检测。常规的纯化方法不能够完全去除残留的荧光染料，这会导致序列彩图中出现严重的干扰峰。优势a.  DNA提取环节:利用自主研发的BAC克隆DNA提取试剂和独特的提取方法，瑞金特生物可以利用96孔深孔板进行BAC克隆的培养和批量化DNA提取，获得的BAC DNA的质量和纯度完全满足测序需求。b.  测序反应环节:对测序反应体系进行了优化，在反应体系中添加了以MgCl2为主要成分的自制缓冲液，增加了BigDye中Taq酶的活性，从而极大提高了测序的质量和成功率。c.  测序反应纯化环节:采用BigDye XTerminator纯化试剂盒，可稳定地去除BAC末端测序中的染料污染，从而消除了干扰峰的出现，并且能够显著增强测序数据的信号强度。

实验原理DNA甲基化存在于大多数真核生物中，一般发生在CpG双核苷酸中胞嘧啶的5’UTR区，起调控作用。CpG的胞嘧啶大概有80%被甲基化，20%处于基因调控区的CpG岛中。BSP甲基化测序（Bisulfite Genomic Sequencing PCR）的原理通过对基因组DNA进行重亚硫酸盐处理，非甲基化的胞嘧啶被脱氨基而转变成尿嘧啶，在随后的PCR反应中尿嘧啶转变成胸腺嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不能被脱氨基，在反应完成时被保留，我们将扩增得到的PCR产物进行TA克隆测序，就可以分析甲基化发生的具体情况。该方法实验结果准确性高，是甲基化检测的金标准。实验流程

简介：瑞金特生物实验中心引进美国安捷伦公司的液相色谱质谱联用仪。形成了高通量、高灵敏度和高分辨率的规模化蛋白质分析支撑技术体系，为促进蛋白质组学及相关研究的发展，共享先进的技术资源，近年来生物质谱实验室蛋白质/多肽质谱鉴定、生物工程药物结构确证和蛋白质组学多项成熟的分析技术已为国内外客户提供了广泛的服务。设备仪器：美国安捷伦公司Agilent （xct-6330） 型号的液相色谱仪，MS为美国热电公司的TSQ型号质谱仪；质谱仪采用ESI（电喷雾电离）离子源，MS/MS 串连四极杆分析器。可在线检测极性有机化合物、核酸、多肽、小分子蛋白质及其化学修饰产品的实际分子量，并对送检样品进行分子量鉴定，纯度及修饰效果分析。质量范围M/Z 10～2,000 分辨率R=2M设备应用：芯片/质谱 (HPLC-Chip/MS) ——显著提高了纳流液-质联用分析结果的灵敏度，可靠性和分析速度 安捷伦推出了世界第一台的基于微流控技术的纳流液相色谱芯片-质谱平台。 这项技术将主要用于蛋白质组学和药物分析方面。其核心是采用可重复使用的聚合物液相色谱芯片取代传统的液相色谱柱。这个平台将多维色谱集成在一块芯片上，采用插拔式设计，操作简单与标准液相色谱/质谱联用仪相比， 它的其灵敏度提高了3,500倍。尽管芯片的体积很小，但是可以容纳最长20 厘米的有C18填料的色谱柱。液相色谱/芯片作为一个模块与安捷伦的所有6000系列液-质联用仪完全兼容。 液相色谱-芯片技术主要应用蛋白质组学研究和药物标靶研究等领域。有关 的应用发表在许多国际知名的杂志上，如Analytical Chemistry; Electrophoresis, PNS上液相色谱芯片产品主要包括七种类型的芯片涵盖大分子和小分子的应用：* 酶解蛋白质鉴定芯片 #1 * 酶解蛋白质鉴定芯片#2 * 寡聚糖的芯片 * 直接进样芯片* 小分子芯片 * 质谱校正和诊断芯片 * 全蛋白质分析芯片测试范围：多肽、蛋白质的电喷雾质谱分子量测定以及天然产物分子、生物大分子、有机分子的质谱测试和研究送检样品要求：样品应尽量不含盐份、离子表面活性剂、去垢剂及一些难挥发性盐。样品送检量、溶解方式以及未知可否做质谱检测的样品可与我们的工作人员联系以便提高检测效率。（送样单请附带检测样品的品名及精确计算分子量）送样须知：A：样品量：50pmol干粉或1ug/uL以上（一般测试）、100pmol干粉或1ug/uL以上（MALDI串联质谱分析）、100ug干粉以上（二硫键分析、糖基化分析，磷酸化分析，其他修饰分析）、10ug干粉以上（SDS-PAGE或IEF）；B：盐含量：挥发性无机盐，<20mM，请勿使用PBS、SDS和尿素等质谱干扰物质；C：考马斯亮蓝染色样品可全部接收，银染过程中不得使用戊二醛作为固定剂；D：请告知样品是否有修饰，并请注明修饰方式。主要应用 :* 蛋白质组学研究 * 寡聚糖和糖蛋白的研究 * 小分子化合物分析* 药物发现和研发 * 食品和环境样品分析检测报告：从收到样品起1-2个工作日内可给出样品的检测报告，以电子邮件的形式发给您并附带检测结果分析。包括结果有：一级质谱：质谱图、肽段分子量、数据库检索结果； 二级质谱：质谱图、肽段分子量、数据库检索结果、肽段氨基酸序列、修饰位点等；

体外定点突变技术通过PCR等方法向目的DNA片段中引入所需变化，包括碱基的添加、删除、点突变等。此技术能迅速、高效的提高DNA所表1  基因定点突变体外定点突变技术通过PCR等方法向目的DNA片段中引入所需变化，包括碱基的添加、删除、点突变等。此技术能迅速、高效的提高DNA所表达的目的蛋白的性状及表征，是实验室中改造、优化基因常用的手段，也是研究蛋白质结构和功能之间复杂关系的有力工具。可根据不同的研究目的，为您量身定做不同的实验方案。1基因定点突变服务特色a.  可对任何位置的位点进行突变。b.  可对含有重复序列或高GC序列进行突变。  提供结果a.  高纯度质粒，总量约2μgb.  含有重组质粒的菌液c.  测序原始图谱和序列d.  实验报告（实验流程、质控点）2  PCR定点突变实验原理PCR定点突变是根据突变方案设计合成覆盖突变位点的双向引物，通过PCR向目的DNA片段中引入所需的变化，如碱基的插入、删除、替换等。定点突变能迅速、高效的提高DNA所表达的目的蛋白的性状及表征，是基因研究工作中一种非常有用的手段。实验流程

实验原理miRNA是在真核生物中发现的具有调控功能的内源性非编码RNA，大小约20~25个核苷酸。我们根据成熟miRNA序列信息，合成含有茎环结构的前体miRNA连接至含侧翼序列的表达载体中，将其转染/病毒包装感染进入细胞后，由II型启动子（CMV）启动表达，经核酸酶的剪切加工，组装RNA诱导的沉默复合体，通过碱基互补配对的方式识别靶mRNA，并根据互补程度的不同指导沉默复合体降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻译。实验流程

实验原理继植物中发现基因沉默现象后，动物细胞中的双链RNA诱导的基因沉默现象也被阐明，并于2006年获得诺贝尔医学奖的肯定，足以说明RNAi技术在医学领域即将发挥的开创性作用。siRNA（Small interfering RNA)是21-25核苷酸的小分子RNA，由Dicer酶加工双链RNA而成。siRNA与体内多种酶类结合形成RNA诱导的沉默复合物（RISC），从而激发与之互补的目标mRNA的降解。天然的RNAi现象存在于包括人类在内的动植物体内，在调节基因表达和预防病毒感染方面起到重要作用。实验流程

简介：单克隆抗体（单抗）应用淋巴细胞杂交瘤技术将免疫动物的B淋巴细胞和骨髓瘤细胞融合形成杂交瘤细胞，通过HAT筛选，ELISA抗体检测，有限稀释克隆化，选择出具有分泌抗体功能又能无限繁殖的来源于单一B细胞的杂交瘤细胞，并产生抗体，就是单克隆抗体。单抗的最大优势是它的特异性、均一性、高效性和无限供应性。在免疫学、医学、生物学等领域的基础研究和临床医学上，包括对疾病(包括癌症)的诊断、预防和治疗等方面，均显示出巨大的生命力。实验步骤：1. 每种抗原免疫5只Balb/c小鼠2. 选取ELISA效价较高的小鼠，取脾细胞与SP2/0细胞融合3. 进行2~4次克隆化及ELISA筛选，确保杂交瘤细胞分泌抗体的稳定性4. 抗体亚类鉴定5. 至少选择2株杂交瘤细胞的冻存，并免费提供一年的保种服务单抗制备标准流程：抗体的应用：制备的抗体可能用于ELISA、WB、IHC、IP等实验。客户需提供的材料及信息:a.客户需要提供2mg以上的纯化蛋白质，纯度≥90%(SDS-PAGE检测)，若带融合标签需说明并提供筛选蛋白b.如为多肽，客户要提供两种偶联不同蛋白质的多肽各4mg，未偶联多肽1mg，偶联多肽纯度≥85%结果提供：实验报告 免疫前血清（20μl） 免疫后血清（20μl）抗体上清（至少3株,1ml/株） 杂交瘤细胞（3株） 抗体亚型如需要纯化的客户增加如下结果：纯化抗体（3株）(纯度≥90％,浓度≥1mg/ml,每株5mg） 免疫效价 抗体亲和力常数相关说明：A、免疫原可以为重组蛋白、天然蛋白、合成多肽、偶联小分子等。B、客户需要承诺外的细胞株。（联系我们老师）C、客户需要对承诺外的细胞株抗体进行纯化。（联系我们老师）D、如客户需要非IgG类的其他细胞株。（联系我们老师）

短串联重复序列（short tandem repeat，STR），它广泛并均匀地存在于真核生物基因组中，一般由一个长2～6bp的核心序列经多次串联重复排列而成，重复次数大多在10～60次之间。个体间核心序列的重复次数呈高度变异性，构成了STR的遗传多态性。由于STR具有分布广泛均匀、多态性丰富、信息量大、检测简便等优点，已广泛应用于遗传图谱绘制、基因定位、法医鉴定、遗传病诊断等诸多领域。瑞金特生物可为您提供特定区域扫描、人致病基因定位（全基因组扫描）两种STR分型检测服务。特定区域扫描瑞金特生物可根据客户指定的染色体区域寻找微卫星标记，进行定点扫描技术路线优势：a.  可以提供荧光引物的合成。b.  实验周期短：正常情况下，3~4天就可以出结果。c.  结题报告数据明显，通过表格和峰图可以清楚的看到片段大小、丰度、纯合杂合等分型信息。送样要求a.  送样要求，PCR产物或基因组DNA：浓度≥50ng/μl，总体积≥20μl；新鲜组织样品：总量≥100mg的新鲜组织样品或1～2ml血液样品；b.   送样时，请注意避光保存，同时在订单上标注好是STR样本；c.  我们默认使用的内参为ROX500和LIZ500，如需使用其他内参，请自行提供；d.  建议使用Fam、Hex、Tamra三种荧光标记；为尽量避免多种荧光信号的相互干扰，不建议同管检测使用的荧光多于2种；多种荧光同管检测，PCR产物大小需相差50bp以上；常见问题（1）你们是怎么区分出我送的未知荧光呢？答：我们使用ROX500作为红色内标时，可以鉴别出蓝色荧光和绿色荧光；LIZ500作为橙色内标时，四种荧光都可以鉴别的出来。（2）STR 检测用的仪器是什么？名字与型号，厂家， 最多能测多少个 bp？答：我们使用的仪器是 ABI3730XL Analyzer (美国），最多能测 1500bp。（3）上样量（分子量内标、 甲酰胺及 PCR 产物各需要多少）？答：先对 PCR 产物进行纯化，随后取 1ulPCR 产物和 10ul 的内标[加入1000 ul HIDI 和5ul ROX500/LIZ500，震荡、混匀（ 96 个样品用量）]进行上样。（4）公司能否提供 Genemapper  软件？答：这个软件是正版软件，不能随意安装，不便提供。另外老师您可以在发送给您结果的邮件中下载分析软件 Genemarker（在英文操作环境下进行）。（5）其中 Allele， Size， Height， Peak Area, Data Point 分别代表什么？如何解释？答：Allele ： Displays the label of the allele according to the Label settings of the analysis methodSize ： Displays the calculated size (in bp) of the associated peak.Height ： Displays the height (in RFU) of the associated peak.Peak Area ： Displays the calculated area underneath the associated peak.Data Point ：Displays the data point that defines the center of the associated peak in the sample data

实验原理继植物中发现基因沉默现象后，动物细胞中的双链RNA诱导的基因沉默现象也被阐明，并于2006年获得诺贝尔医学奖的肯定，足以说明RNAi技术在医学领域即将发挥的开创性作用。siRNA（Small interfering RNA)是21-25核苷酸的小分子RNA，由Dicer酶加工双链RNA而成。siRNA与体内多种酶类结合形成RNA诱导的沉默复合物（RISC），从而激发与之互补的目标mRNA的降解。天然的RNAi现象存在于包括人类在内的动植物体内，在调节基因表达和预防病毒感染方面起到重要作用。实验流程