短串联重复序列(short tandem repeat,STR),它广泛并均匀地存在于真核生物基因组中,一般由一个长2~6bp的核心序列经多次串联重复排列而成,重复次数大多在10~60次之间。个体间核心序列的重复次数呈高度变异性,构成了STR的遗传多态性。由于STR具有分布广泛均匀、多态性丰富、信息量大、检测简便等优点,已广泛应用于遗传图谱绘制、基因定位、法医鉴定、遗传病诊断等诸多领域。
瑞金特生物可为您提供特定区域扫描、人致病基因定位(全基因组扫描)两种STR分型检测服务。
特定区域扫描
瑞金特生物可根据客户指定的染色体区域寻找微卫星标记,进行定点扫描
技术路线
优势: a. 可以提供荧光引物的合成。 b. 实验周期短:正常情况下,3~4天就可以出结果。 c. 结题报告数据明显,通过表格和峰图可以清楚的看到片段大小、丰度、纯合杂合等分型信息。 送样要求 a. 送样要求,PCR产物或基因组DNA:浓度≥50ng/μl,总体积≥20μl;新鲜组织样品:总量≥100mg的新鲜组织样品或1~2ml血液样品; b. 送样时,请注意避光保存,同时在订单上标注好是STR样本; c. 我们默认使用的内参为ROX500和LIZ500,如需使用其他内参,请自行提供; d. 建议使用Fam、Hex、Tamra三种荧光标记; 为尽量避免多种荧光信号的相互干扰,不建议同管检测使用的荧光多于2种;多种荧光同管检测,PCR产物大小需相差50bp以上; |
常见问题
(1)你们是怎么区分出我送的未知荧光呢?
答:我们使用ROX500作为红色内标时,可以鉴别出蓝色荧光和绿色荧光;LIZ500作为橙色内标时,四种荧光都可以鉴别的出来。
(2)STR 检测用的仪器是什么?名字与型号,厂家, 最多能测多少个 bp?
答:我们使用的仪器是 ABI3730XL Analyzer (美国),最多能测 1500bp。
(3)上样量(分子量内标、 甲酰胺及 PCR 产物各需要多少)?
答:先对 PCR 产物进行纯化,随后取 1ulPCR 产物和 10ul 的内标[加入1000 ul HIDI 和5ul ROX500/LIZ500,震荡、混匀( 96 个样品用量)]进行上样。
(4)公司能否提供 Genemapper 软件?
答:这个软件是正版软件,不能随意安装,不便提供。另外老师您可以在发送给您结果的邮件中下载分析软件 Genemarker(在英文操作环境下进行)。
(5)其中 Allele, Size, Height, Peak Area, Data Point 分别代表什么?如何解释?
答:Allele : Displays the label of the allele according to the Label settings of the analysis method
Size : Displays the calculated size (in bp) of the associated peak.
Height : Displays the height (in RFU) of the associated peak.
Peak Area : Displays the calculated area underneath the associated peak.
Data Point :Displays the data point that defines the center of the associated peak in the sample data