蛋白质是基因表达的产物，但并不与基因一一对应。对于一个生物体来说，每个细胞都有着一套相同的基因，但是每个细胞中所含的蛋白质却不一定相同。蛋白质的种类繁多、结构复杂、生物活性也不尽相同，同一蛋白质还可以存在不同的翻译后修饰情况，因此蛋白质的分析研究会比基因分析更困难和复杂。蛋白分析服务蛋白分析可以是对整个细胞或组织的蛋白质组进行分析，也可以是对特定蛋白或多个蛋白质进行分析。蛋白分析包括分析蛋白质的含量、纯度、分子量、氨基酸组成、结构、以及蛋白质相互作用等。根据具体分析的对象和参数的不同，蛋白分析的方法也有所不同。百泰派克生物科技利用不同技术方法为广大科研工作者提供多种蛋白分析服务，包括蛋白质样品制备、蛋白性质分析、蛋白组学分析以及多肽组学等服务。百泰派克提供以下蛋白分析服务：蛋白质样品制备服务蛋白质水解服务蛋白性质分析服务蛋白组学分析服务糖组学分析服务多肽组学联系我们点击立即咨询>>点击提交需求>>科研服务电话：182-4221-8588访问品牌官网>>百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；2、获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；3、业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；4、七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；5、服务3000+企业，10000+客户的选择；6、致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

百泰派克生物结合MALDI-TOF质谱系统与LC-MS/MS质谱系统，提供专业准确的蛋白胶点、胶条、IP样品，CO-IP样品蛋白鉴定服务。可鉴定的样品包括：1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条，2DE PAGE中的蛋白胶点，蛋白表达产物，免疫共沉淀（Co-IP）样品。其中，蛋白质样品的鉴定前处理过程严格按照Nature Methods发表的文章：Universal sample preparation method for proteome analysis进行，保证鉴定试验中得到更高的肽段覆盖率。质谱鉴定的原理则是基于鸟枪法（Shot-gun）：将蛋白条带或者蛋白溶液酶切成肽段混合物，经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分，进入高分辨率质谱仪中进行分析。检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对，结合匹配度打分及错配过滤，可得到肽段的确切序列，进而拼接出各蛋白的完整序列，从而实现对蛋白的鉴定。蛋白质质谱鉴定流程基于鸟枪法（shot-gun）LC-MS的蛋白鉴定流程关于样品1D SDS PAGE /2D PAGE gels样品：1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain样品均可进行蛋白的鉴定试验；2. 银染的样品有可能与后续的质谱分析不兼容，我们推荐您使用下面的产品或者实验步骤进行银染实验：ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)3. 银染的样品请不要进行脱色处理液体样品（In solution format）：1. 假如样品中蛋白量＞10ug，我们对样品的缓冲体系没有要求；2. 假如样品中蛋白量＜10ug，样品准备过程中尽量减少SDS等表面活性剂的使用，并注意降低盐浓度；3. 提交样品过程中，注意提供样品的缓冲体系和样品中蛋白的预估含量；Co-IP样品：1. 如果您洗脱的样品需要跑胶，请按照1D SDS PAGE样品准备要求准备样品即可；2. 如果您直接提交洗脱样品，我们推荐使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 缓冲体系进行蛋白洗脱，保证洗脱缓冲体系与后续的质谱实验兼容；样品运输：1. 我们推荐您将样品冻干后进行运输，冻干样品中蛋白非常稳定。2. 液体样品推荐干冰运输，短途运输冰袋也可以。注意事项： 利用质谱进行蛋白样品的鉴定，在样品准备过程中需佩戴手套和头套，尽量避免自身角蛋白（keratin）对样品的污染。研究案例该项目是中国科学院生物物理所一位老师将她的Co-IP的样品寄给我们进行蛋白鉴定。得到的部分结果如下图所示：蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定研究案例从图中可以看出，我们提供的结果报告中包含鉴定到的蛋白的Accession Number, Peptide coverage, 鉴定出的肽段信息，鉴定出的肽段的修饰信息以及对鉴定到的蛋白的详细描述。中/英文项目报告：在技术报告中，百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：1. 实验步骤（中英文）2. 相关的质谱参数（中英文）3. 质谱图片4. 原始数据5. 鉴定的蛋白质详细信息蛋白胶点、胶条、IP样品质谱鉴定一站式服务您只需下单-寄送样品百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告相关服务蛋白质质谱鉴定Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定1D SDS-PAGE和IEF服务二维凝胶电泳服务CO-IP免疫共沉淀法蛋白互作分析百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack TechnologyCompany Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测测分析服务:2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量量研究服务3、业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;5、服务3000+企业,1000+客户的选择!

靶向代谢组学（Targeted Metabolomics）是代谢组学研究的重要组成部分，也是全代谢组研究的延伸与拓展。相对于全代谢组分析而言，靶向代谢组分析具有特异性强，检测灵敏度高和定量准确等几个特点。通过对血液、尿液或其他体液以及组织中某一特定的代谢物的富集与准确定量定性分析，一方面可以结合其它实验数据揭示相关的分子生物学作用机制，另一方面，也可以为后续代谢分子标志物的深入研究和开发利用提供有力支持。靶向代谢组学可以用于：验证有非靶向代谢组学实验提出的假说；进行基于假说的探索性实验，针对特定代谢物，研究代谢模型。靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。靶向代谢组学鉴定一般采用GC/MS系统的选择性离子监测 (SIM)，或在三重串联四极杆LC/MS系统上用多反应离子监测 (MRM) 进行靶向MS/MS。SIM比全扫描图谱采集具有更高的灵敏度，在单四极杆质谱中，这种灵敏度增强的原因是延长了所选择离子的采集时间。因为监测的是一个很小的质量窗口，所以质量色谱图只代表对极为特定质量的检测。在大多数情况下，灵敏度可以提高 10 倍。MRM是进行质谱定量的选择方法，与SIM相比更为灵敏、更加特异。可以产生独特的碎片离子，可对非常复杂基质中的目标化合物进行监测和定量。靶向代谢组学的一般分析流程为：1. 数据采集 第一步是得到标准品。如果无法从市场上买到，就必须定制合成。然后通过优化产物离子碰撞能量以得到的信号，再通过测定三重串联四极杆测定代谢物的MRM跃迁值。2. 定量 接下来用定量分析软件对MRM数据进行处理，得到报告。3. 统计分析和解释 将定量报告输入统计分析软件包，用统计工具，如ANOVA，对数据进行处理。靶向代谢组学分析流程 靶向代谢组学研究路线 百泰派克已开发的靶向代谢组学服务 Targeted Metabolomic Pathways糖类及糖代谢Organic CompoundsAcyl CoAs氨基酸及其衍生物Animal HormonesAldehydesBioamineBile AcidsCarnitinesCarotenoidsFatty AcidsFlavoneFlax-LiganansBiomarkersNucleotidesOxysterolsOrganic AcidsPlant HormoneResveratrolTryptophan MetabolitesThiolsVitamins & CoenzymesInorganic CompoundsMetal/MetallomicsPolyphenols百泰派克生物科技其他靶向代谢组学服务：鞘氨醇碱分析服务己糖神经酰胺二酰甘油甘油三酯短链脂肪酸内源性大麻素分析服务酰基辅酶A分析心磷脂分析橄榄油酚分析蜡酯分析类花生酸代谢物（尿液）分析多糖的分析方法和过程羟基二十碳四烯酸（HETEs）分析总反式脂肪酸分析ω－6脂肪酸分析前列腺素分析神经节苷脂分析脂氧合酶产物分析类花生酸分析聚戊烯醇分析超长链脂肪酸分析服务霉菌酸分析服务胆固醇酯分析服务鞘氨醇分析服务甘油磷脂分析服务游离脂肪酸（FFA）分析服务白三烯分析服务关于样品1.微生物和细胞样本：迅速钝化代谢活动（淬灭），同时保持细胞不裂解2.动物体液（如尿、血、组织、器官、唾液）：采样后要迅速预处理，如加入抗凝血剂、防腐剂，并立即冷冻处理（-80℃）3.植物样本：采集后迅速冷冻（液氮），然后转入-80℃保存，200mg/例。4.血清样品：500ul/例（不得低于200ul/例），一定避免反复冻融。(血液收集在离心管中静置30分钟进行凝固。然后离心取上清装载干净的离心管中，再离心5分钟，8000rpm，取上清分装到冻存管中，每管0.5ml，-80℃冻存寄送。)5.尿液样品：1ml/例，原则上可以多取一点（尿液直接分装到离心管中，每管1ml，添加一滴（约10ul）质量体积为1/100（w/v）的叠氮化钠，-80℃冻存寄送）中/英文数据报告在最终的技术报告中，百泰派克生物科技会为您提供详细的中/英文双语版技术报告，报告包括：1. 实验步骤（中英文）2. 相关的质谱参数（中英文）3. 质谱图片4. 原始数据5. 代谢分子鉴定结果靶向代谢组学一站式服务您只需下单-寄送样品百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告相关服务代谢组学非靶向代谢组分析脂质代谢组学研究非靶向脂质组学靶向脂质组学靶向蛋白质组学百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检划分析服务;2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物物质量研究服务;3、业务范围要盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求,5、服务3000+企业,10000+客户的选择

新陈代谢网络是十分复杂的网络，而人体的代谢网络尤为复杂。现在多数信号通路的研究都是集中在代谢网络的一个很小的领域。基因组学、蛋白组学研究虽然已经揭示了部分调节通路，但是和代谢网络直接相关的是代谢产物。从茫茫多的代谢产物中选取研究对象，无疑是大海捞针。非靶向性代谢组学又称为发现代谢组学，主要是将对照组和实验组的代谢组（某一生物体的全部代谢物）进行比对，以找出其代谢物的差异。代谢组学研究通过一定的手段能够帮助研究员从众多代谢产物挑出来，提供一个“航拍”的视角，一目了然地发现差异性代谢产物。然后通过已知的代谢通路逆推找出调节酶和基因，完成疾病发病机制、有效制剂治疗机制等方面的研究。百泰派克公司推出非靶向代谢组学分析服务技术包裹，基于之前发表的文献建立了多种样品处理的技术平台，您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的样品寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括样品准处理、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。百泰派克非靶向性代谢组服务 植物代谢组学 微生物代谢组学 血清代谢组学 尿液代谢组学 体液代谢组学 外泌体非靶向代谢组学 脑脊液非靶向代谢组学 1. 代谢谱分析(也称为差异表达分析)：在一组实验和对照样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物；2. 鉴定：进行代谢谱分析后，测定这些代谢物的化学结构；3. 解释：解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。非靶向性代谢组学分析研究路线 非靶向性代谢组分析研究路线 非靶向性代谢组学分析研究技术1. GC-MS（气相色谱）是代谢组学研究的经典技术，具有技术成熟稳定、分辨率高等特点，同时，由于具有相对完善的数据库，使得定性也更为准确，缺点则主要表现在样品处理复杂，并且对于不易衍生化的物质定性和定量较困难，影响了该技术在更大范围内的应用。2. LC-MS（液相色谱）优势主要表现在样品制备和前处理简单、实验重复性好，分辨率高，分离和分析范围广，缺点则主要表现在数据库完善程度不够，定性相对困难。关于样品1. 微生物和细胞样本：迅速钝化代谢活动（淬灭），同时保持细胞不裂解2. 动物体液（如尿、血、组织、器官、唾液）：采样后要迅速预处理，如加入抗凝血剂、防腐剂，并立即冷冻处理（-80℃）3. 植物样本：采集后迅速冷冻（液氮），然后转入-80℃保存，200mg/例4. 血清样品：500ul/例（不得低于200ul/例），一定避免反复冻融。(血液收集在离心管中静置30分钟进行凝固。然后离心取上清装载于干净的离心管中，再离心5分钟，8000rpm，取上清分装到冻存管中，每管0.5ml，-80℃冻存寄送。)5. 尿液样品：1ml/例，原则上可以多取一点（尿液直接分装到离心管中，每管1ml，添加一滴（约10ul）质量体积为1/100（w/v）的叠氮化钠，-80℃冻存寄送）中/英文项目报告在技术报告中，百泰会为您提供详细的中/英文双语版技术报告，报告包括：1. 实验步骤（中英文）2. 相关的质谱参数（中英文）3. 质谱图片4. 原始数据5. 代谢组学分析结果非靶向代谢组学一站式服务您只需下单-寄送样品百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告相关服务靶向代谢组学脂质代谢组学研究非靶向脂质组学未知代谢物鉴定代谢通量分析服务代谢组学生物信息学分析百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检划分析服务;2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物物质量研究服务;3、业务范围要盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求,5、服务3000+企业,10000+客户的选择

糖基化修饰蛋白中的糖基化位点分析对研究蛋白结构及功能具有重要的意义。百泰派克公司提供基于LC-MS/MS的糖型相对含量分析服务，首先选用多种酶对蛋白进行酶解，然后于重标H218O中，采用PNGase F或多种的O-糖基酶，将目标蛋白中的糖基酶解下来，此时发生糖基化修饰的肽段将会带上一个18O，通过数据库检索，可以找到发生糖基化修饰的位点。糖基化位点分析技术特点• 鉴定分析耗时相对较短• 检测灵敏度高，重复性好应用领域• 鉴定糖基化蛋白中N-糖基化位点• 鉴定糖基化蛋白中O-糖基化位点关于样品糖基化位点分析样品要求1. 如果您提供的是组织样品，请您干冰将组织样品寄给我们。2. 如果您提供的是蛋白样品，蛋白提取时使用普通的组织、细胞裂解液即可。3. 样品运输：请使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。中/英文项目报告在技术报告中，百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：1. 实验步骤（中英文）2. 相关的质谱参数（中英文）3. N型和O型糖基化位点鉴定信息4. 质谱图片5. 原始数据糖基化位点分析一站式服务您只需下单-寄送样品百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告百泰派克提供以下糖基化位点分析服务N-糖基化位点分析O-糖基化位点分析相关服务生物药糖基化位点检测糖型分析生物药糖谱检测糖基化位点及该位点糖型分析糖基化定量蛋白组学研究糖蛋白分析百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检划分析服务;2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物物质量研究服务;3、业务范围要盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求,5、服务3000+企业,10000+客户的选择

分子量是有机化合物基本的理化性质参数。分子量正确与否往往代表着所测定的有机化合物及生物大分子的结构正确与否。分子量也是多肽、蛋白质等鉴定中首要的参数，也是基因工程产品报批的重要数据之一。基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)是近年来发展起来的一种新型的软电离生物质谱，具有样品消耗量少、灵敏度高、测定速度快、易于实现高通量、可对蛋白进行大规模的鉴定及生物大分子的分子量测定等特点，为蛋白质研究提供了一种强有力的分析测试手段。简便，直观，可直接对大分子混合物进行测定，并且基本不产生碎片峰是MALDI-TOF-MS的优势，因此这项技术在生物大分子分子量测定中得到广泛应用。MALDI-TOF-MS仪器主要由两部分组成：基质附助激光解吸电离离子源（MALDI）和飞行时间质量分析器（TOF）。MALDI的原理是用激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜，基质从激光中吸收能量传递给生物分子，而使生物分子电离的过程。它是一种软电离技术，适用于混合物及生物大分子的测定。TOF的原理是离子在电场作用下加速飞过飞行管道，根据到达检测器的飞行时间不同而被检测即测定离子的质荷比（M/Z）与离子的飞行时间成正比，从而实现对离子的检测。MALDI-TOF的准确度高达0.1%-0.01%，远远高于目前常规应用的SDS电泳与高效凝胶色谱技术，目前可测定生物大分子的分子量范围为700-600000Da。百泰派克公司采用Bruker公司的ultrafleXtreme™ MALDI TOF/TOF质谱系统，为广大科研工作者提供生物分子分子量测定服务，用于分析目标蛋白或多肽的分子量，检测蛋白二聚体，以及对样品纯度进行大体评估。样品要求1. 样品的需要量约为10-50ug；2. 样品纯度>90%；3. 样品准备过程中尽量避免表面活性剂，例如SDS、Triton-X等的使用；盐浓度，例如Tris等也尽量降低；4. 如果您在准备样品的过程中必须要用到表面活性剂以及较高的盐浓度，我们收到您的样品后会首先通过相关实验对上述化合物进行去除，然后进行后续的分子量测定。样品运输1. 我们推荐您将样品冻干后进行运输，冻干样品中蛋白非常稳定。2. 液体样品推荐干冰运输，短途运输冰袋也可以。注意胶粒样品或者转移到PVDF膜上的样品不适合于分子量测定实验。研究案例在MALDI-TOF的应用过程中，除了可以检测样品的分子量，还能提供样品本身纯度的信息。如下图所示，样品在理论分子量1046.6Da范围出现明显的信号峰，且样品纯度较好。分子量测定研究案例中/英文项目报告在技术报告中，百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：1. 实验步骤（中英文）2. 相关的质谱参数（中英文）3. 质谱图片4. 原始数据5. 蛋白质分子量和纯度分析结果蛋白质分子量测定一站式服务您只需下单-寄送样品百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告相关服务蛋白质复合物，蛋白质与小分子复合物分子量测定高分辨质谱分子量鉴定MALDI TOF分子量分析精确质量测定百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检划分析服务;2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物物质量研究服务;3、业务范围要盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求,5、服务3000+企业,10000+客户的选择

GO（Gene Ontology）是基因本体联合会（Gene Ontology Consortium）所建立的数据库，旨在建立一个适用于各种物种的，对基因和蛋白功能进行限定和描述的，并能随着研究不断深入而更新的语义词汇标准，适用于各物种。通过建立一套具有动态形式的控制字集（controlled vocabulary），来描述基因及蛋白质在细胞内所扮演的角色，从而来全面描述生物体中基因和基因产物的属性。GO数据库总共有三大类，分别是生物学过程（Biological Process, BP）、细胞定位（Cellular Component, CC）和分子功能（Molecular Function, MF），各自描述了基因产物可能行使的分子功能，所处的细胞环境，以及参与的生物学过程。GO数据库中一个基本的概念是节点，每个节点都有一个名称，比如“Cell”、“Fibroblast Growth Factor Receptor Binding”或者“Signal Transduction”，同时有一个唯一的编号，如“GO:nnnnnnn”。基于鉴定到的蛋白ID，采用mapping的方式从Uniprot数据库中得到蛋白质的GO数据库注释信息，对蛋白质进行功能分类注释。针对BP、CC和MF中所涉及的GO节点，列出所有相应蛋白质个数，同时分别对表达蛋白的二级分类情况做出统计图。1. GO二级分类统计图 图1 差异表达蛋白的GO二级注释注：横坐标为GO分类，纵坐标左边为蛋白数目所占百分比，右边为蛋白数目。此图展示的是在差异表达上调蛋白和下调蛋白GO各二级功能的蛋白富集情况，体现两个调节方向下各二级功能的地位，具有明显比例差异的二级功能说明差异表达上调蛋白与下调蛋白的富集趋势不同，可以重点分析此功能是否与差异相关。2. GO levels分类统计图根据不同levels中GO节点注释到的蛋白数量，选择排名前20个GO节点进行展示，如图所示：图2 蛋白质在不同level中的注释结果统计图注：横坐标是富集到蛋白的百分比，纵坐标是按层级从小到大排列。不同level用不同的颜色显示，每个柱子后面的数字是该分类中的蛋白数量。3. topGO蛋白质富集分析百泰派克采用topGO对差异表达蛋白进行富集分析，可以得到差异表达蛋白在GO节点中的富集显著性。并对显著富集的节点在GO体系中的层级关系以有向无环图的形式进行直观展示。topGO有向无环图能直观展示差异表达基因富集的GO节点（Term）及其层级关系，是差异表达基因GO富集分析的结果图形化展示，分支代表包含关系，从上至下所定义的功能描述范围越来越具体。在有向无环图中，箭头代表包含关系，即该节点的所有基因同样注释到其上级节点中。差异表达蛋白的topGO分子功能有向无环图如下：图3 差异表达蛋白topGO富集有向无环图（分子功能）注：对每个GO节点进行富集，在图中用方框表示显著度高的10个节点，图中还包含其各层对应关系。每个方框（或椭圆）内给出了该GO节点的内容描述和富集显著性值。不同颜色代表不同的富集显著性，颜色越深，显著性越高。百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检划分析服务;2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物物质量研究服务;3、业务范围要盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求,5、服务3000+企业,10000+客户的选择

SILAC是细胞培养条件下稳定同位素标记技术(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture, SILAC)的简称。SILAC实验流程是：细胞培养基中加入轻、中或重型稳定同位素标记的必需氨基酸赖氨酸(Lys)和精氨酸(Arg)，在细胞生长过程中使新合成的蛋白会带上稳定同位素标签。等量混合各类型蛋白质，酶解后进行质谱分析。通过比较一级质谱图中不带标记/带同位素标记质谱峰型的面积大小进行相对定量，同时二级谱图对肽段进行序列测定从而进行蛋白鉴定。与SILAC类似，二甲基Dimethyl标记也是一种同位素蛋白标记的方法。Dimethyl是一种小分子同位素化学标记物，通过化学标记的方法标记细胞裂解后的蛋白或多肽的N端或者赖氨酸的ε氨基基团，使蛋白/多肽标记上不同的Dimethyl标签。除了标记方法的差别外，SILAC/Dimethyl两种标记的质谱分析方法基本一致，而且具有相近的分析精度和广度，在定量蛋白组学分析研究中受到越来越广泛的运用。百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台，Orbitrap Fusion质谱平台，Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，推出基于SILAC/Dimethyl的定量蛋白组分析服务技术包裹，您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的细胞寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括细胞培养、细胞标记、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。SILAC定量蛋白组学实验流程SILAC定量蛋白组学实验流程关于样品1.您只需使用干冰将冻存细胞寄给我们即可，同时保证细胞具有可以传代培养5次以上的能力；2.如果您需要自己标记细胞并完成细胞的刺激等处理过程，您只需要将标记完成并且经过处理的细胞样品或者蛋白样品干冰寄给我们即可；对于每个样品，需要保证含有50-100ug蛋白。Silac与Dimethyl标记法对比SIALC与Dimethyl标记法对比SIALC与Dimethyl标记法对比2总的来说，SILAC的重复性比Dimethyl稍高一些，因为不同的SILAC样品在蛋白酶切之前就已经混合在一起，而Dimethyl标记的是酶切后的多肽片段，受到体系稳定性影响更多，因此重复性稍逊于SILAC。但是Dimethyl作为一种优质价廉的标记手段也得到越来越广泛的应用。中/英文项目报告在技术报告中，百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：1. 实验步骤（中英文）2. 相关的质谱参数（中英文）3. 质谱图片4. 原始数据5. 蛋白差异水平分析6. 生物信息学分析SILAC/Dimethyl定量蛋白组学一站式服务您只需下单-寄送样品百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告相关服务定量蛋白组分析4D蛋白质组学基于Label Free的定量蛋白组分析基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILACTMT/iTRAQ/MultiNotch定量蛋白组学分析基于TMT的蛋白质组学分析SWATH定量蛋白组学服务DIA定量蛋白质组学2D-DIGE定量蛋白质组学靶向蛋白质组学MRM/PRM定量蛋白组学分析绝对定量分析（AQUA）翻译后修饰蛋白组分析蛋白质组学生物信息学分析百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检划分析服务;2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物物质量研究服务;3、业务范围要盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求,5、服务3000+企业,10000+客户的选择

MRM(Multiple Reaction Monitoring)是一种研究目标蛋白分子的靶向定量蛋白组学研究方法。MRM基于目标分子的信息，有针对性的选择数据进行质谱数据采集，对于符合目标离子规则的信号进行采集，去除不符合规则的离子信号的干扰。MRM质谱分析经过三个阶段：1, 通过MS筛选出与目标分子特异性一致的母离子; 2, 碰撞碎裂这些母离子，去除其他离子的干扰；3, 只对选定的特异MS/MS2离子进行质谱信号的采集。MRM质谱技术是高精准度的蛋白定量鉴定技术，是一次性精准定量研究复杂样品中多个目标蛋白的绝佳方法。如果借助同位素标记的目标肽段作为内参，可以实现蛋白绝对定量鉴定。百泰派克公司采用AB SCIEX TripleTOF 5600，AB SCIEX Triple Quad™ 5500，Q Exactive, Fusion质谱平台结合Nano-LC，推出MRM/PRM靶向定量蛋白组分析服务技术包裹。您只需要将您所需研究的目标蛋白信息提供给我们，我们提供一站式MRM定量蛋白分析服务。包括MRM方法建立和优化、特异肽段挑选、同位素标记肽段、质谱分析、原始数据分析、生物信息学分析。BTP-MRM/PRM定量蛋白组学分析分析平台AB SCIEX TripleTOF 5600，AB SCIEX Triple Quad™ 5500，Q Exactive, FusionMRM/PRM定量蛋白组学分析实验流程MRM-PRM定量蛋白组学分析实验流程MRM-PRM定量蛋白组学分析实验流程2MRM技术特点• 灵敏度高，经过两级质谱选择与目标离子一致的离子，排除干扰离子，极大提升信噪比，提高检测目标离子的准确度• 通量高，一次性可以鉴定多达200多个蛋白• 可以进行绝对定量分析，无需依赖抗体• 高精准度鉴定低丰度蛋白，定量范围跨4个数量级MRM技术应用领域• 对Label-free等非靶向蛋白组研究结果验证• 对多个蛋白质／肽段同时进行绝对定量研究• 研究同源度较高，但缺乏特异识别抗体的蛋白家族变化• 蛋白翻译后修饰定量研究• 生物疾病靶标绝对定量研究MRM分析样品要求MRM-PRM定量蛋白组学分析样品要求MRM技术服务生物信息学分析• MRM谱图分析，蛋白质数据质量评估• 多组分样本PCA分析• 鉴定的蛋白功能注释：GO功能注释、 KEGG功能注释和COG功能注释• 差异表达蛋白统计分析：韦恩图、火山图（Volcano Plot）• 差异表达蛋白聚类分析：层次聚类、K-means聚类• 差异蛋白相互作用分析：基于STRING 数据库进行蛋白互作网络分析SRM/MRM的应用• 验证iTRAQ差异蛋白；• 验证无标记差异蛋白后续产物；• 多肽和蛋白质绝对定量；• 量化疾病指标，建立诊断模型；• 磷酸化蛋白定量，甲基化蛋白定量；• 其他翻译后修饰蛋白质定量；• 通路定量分析。中/英文项目报告在技术报告中，百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：1. 实验步骤（中英文）2. 相关的质谱参数（中英文）3. 质谱图片4. 原始数据5. 蛋白差异水平分析6. 生物信息学分析MRM定量蛋白组学一站式服务您只需下单-寄送样品百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告相关服务平行反应监测PRM服务DIA-PRM蛋白质组学绝对定量分析（AQUA）靶向蛋白质组学定量蛋白组分析4D蛋白质组学翻译后修饰蛋白组分析基于Label Free的定量蛋白组分析基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILACTMT/iTRAQ/MultiNotch定量蛋白组学分析DIA定量蛋白质组学SWATH定量蛋白组学服务2D-DIGE定量蛋白质组学蛋白质组学生物信息学分析百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检划分析服务;2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物物质量研究服务;3、业务范围要盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求,5、服务3000+企业,10000+客户的选择

在生物体的生命活动中，蛋白质的功能是通过蛋白质与蛋白质之间的相互作用来实现的。因此，研究新的蛋白互作可以为研究蛋白质的潜在功能提供新的方向。在诸多蛋白互作鉴定实验中，Pull-down常用于体外蛋白互作检验，以及帮助发现新的互作蛋白。Pull-down实验利用高度纯化且富集的诱饵蛋白捕获在细胞中相互作用较弱或丰度低的靶蛋白，大幅度提高发现新靶蛋白的效率。Pull-down实验的具体步骤为：表达纯化GST、polyHis或Biotin标记的诱饵蛋白，使用固定化亲和配体将诱饵蛋白与固相基质稳定结合，再将诱饵蛋白与待测细胞裂解液进行混合孵育，在这一过程中，诱饵蛋白与目标蛋白相互作用并结合在一起，通过清洗除去非特异性结合的杂蛋白，即可获得与诱饵蛋白相互作用的目标蛋白，再通过质谱分析对目标蛋白进行鉴定。百泰派克公司利用进口的GST pull-down试剂盒，能够快速准确的完成蛋白互作实验，结合公司先进的UPLC-MS质谱平台，推出基于pull down的蛋白分析一站式技术服务，灵敏度高、分辨率准确。我们既可以为您pull down实验后的蛋白样品进行检测，也可以您寄来样品，我们从pull down实验到样品质谱分析一站式解决。您只需要将您的需求和样品寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括样品前处理、pull down、质谱分析、质谱原始数据分析。Pull-down蛋白质鉴定流程Pull-down蛋白质鉴定流程关于样品1D SDS PAGE /2D PAGE gels样品：1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby以及Silver stain样品均可进行蛋白的鉴定试验；2. 银染的样品有可能与后续的质谱分析不兼容，我们推荐您使用下面的产品或者实验步骤进行银染实验：ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)3. 银染的样品请不要进行脱色处理液体样品（In solution format）：1. 如果您洗脱的样品需要跑胶，请按照1D SDS PAGE样品准备要求准备样品即可；2. 假如样品中蛋白量＞10ug，我们对样品的缓冲体系没有要求；3. 假如样品中蛋白量＜10ug，样品准备过程中尽量减少SDS等表面活性剂的使用，并注意降低盐浓度；4. 提交样品过程中，请同时提供样品的缓冲体系和样品中蛋白的预估含量；样品运输：我们推荐您将样品冻干后进行运输，冻干样品中蛋白非常稳定；液体样品推荐干冰运输，短途运输冰袋也可以；注意：利用质谱进行蛋白样品的鉴定，在样品准备过程中需佩戴手套和头套，尽量避免自身角蛋白（keratin）对样品的污染。中/英文项目报告在技术报告中，百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：1. 实验步骤（中英文）2. 相关的质谱参数（中英文）3. 质谱图片4. 原始数据5. 鉴定的蛋白质详细信息Pull-down靶蛋白质谱鉴定一站式服务您只需下单-寄送样品百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告相关服务蛋白质相互作用分析蛋白质相互作用质谱分析CO-IP免疫共沉淀法蛋白互作分析GST pull-down蛋白相互作用分析SILAC与免疫共沉淀质谱联用的蛋白互作分析交联法蛋白相互作用分析Far-Western Blot分析标记转移法蛋白相互作用分析蛋白质质谱鉴定Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物制品表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检划分析服务;2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物物质量研究服务;3、业务范围要盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求,5、服务3000+企业,10000+客户的选择