合理药物设计(Rational Drug Design),是基于结构的药物设计,通过对药物结构和体内靶点相互作用的研究,使药物达到需要的目的,如抑制酶的活性、促进某种物质的释放、阻碍通道等。这过程很大程度上依赖于对靶点和药物三维结构的理解,因此,结构生物学对药物研究产生了深远的影响。对于小分子药物的设计,靶标蛋白-小分子配体的共晶结构(以下简称为“共晶结构”)是药物设计过程中最关键的信息。
共晶结构信息不仅能揭示两者的结合模式和生物活性构象、发现新的结合口袋或变构结合位点,而且丰富了合理药物设计途径,如基于结构的药物设计(SBDD)、基于片段的药物设计(FBDD)、计算机药物辅助设计(CADD)、AI药物发现等。
结构生物学服务包含靶标蛋白的表达纯化、共晶筛选、共晶培养、结构解析等全套服务。
青云瑞晶:全球领先的MicroED技术服务提供商
MicroED技术对于生命科学和药物发现领域所主要关注的蛋白-小分子配体复合物共晶结构的解析具有独特的优势。
基于自主研发的MicroED相关的技术、软件和算法,青云瑞晶提供国际顶尖的商业化MicroED结构生物学服务。同时,青云瑞晶也提供基于同步辐射XRD和CryoEM-SPA冷冻电镜单颗粒的结构生物学服务。
蛋白小分子共晶结构解析目标有三种方法
一 CryoEM-SPA冷冻电镜单颗粒
优点:样品无需结晶,消耗样品量少,适用可溶性蛋白、膜蛋白、大型蛋白复合物
缺点:相对低的分辨率,只适用于大分子量的蛋白(>200KD),设备成本昂贵
二 SCXRD 单晶X射线衍射
优点:蛋白分子量范围广,分辨率高,适用于可溶性蛋白、膜蛋白、蛋白复合物
缺点:蛋白必须结晶,尺寸>50um
三 MicroED微晶电子衍射
优点:蛋白分子量范围广,分辨率高,结晶要求低,大小一般>200nm,适用于可溶性蛋白、膜蛋白、蛋白复合物
缺点:需要>200nm的纳米晶体
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