干细胞是重要细胞,其能够自我更新或者分化成多种类型的细胞,这种能力由细胞信号传导和转录调控所控制,因此转录调控在细胞识别和功能实现过程中起决定作用。干细胞逐步成熟成为终末分化细胞,需要由重要的转录因子适时的激活级联转录程序,多种转录因子和靶基因广泛报告与干细胞的自我更新和多能性有关,包括EGR1, OCT4, FOXD3, FOXO, Nanog, SOX2, SOX18, ETS, GLI, KLF4, MEF2, Myc, RNUX1, Pax6, TCF/LEF 和GATA。分析这些TF的活性可以为干细胞的研究和应用提供有价值的线索。美国Signosis 公司开发一种干细胞转录因子活性多重检测阵列试剂,以同时分析哺乳动物样本中16种干细胞特异的TF,该方法可以用1000-10000个细胞的全细胞裂解物进行。
A. 优点:
美国Signosis 公司基于自有技术研发的干细胞转录因子活性多重检测阵列试剂,具有下列优势:
· 多重分析---一次分析可以检测16种干细胞相关的TF
· 定量比较---二个样本的差异可以定量分析和比较。
· 步骤简单---探针温育、柱分离、板杂交和HRP检测
· 无需贵重仪器---无需如luminex那样的贵重仪器
B. 原理
干细胞转录因子活性多重检测阵列试剂用于同时检测多种TF活性。该技术中,基于TF DNA结合位点的一致性序列,制备一系列生物素标记的探针。当探针混合物与核提取物一起温育时,每个探针寻找相应的TF,形成TF/探针复合物,通过柱离心纯化可以很容易与游离探针分开。结合的探针从混合物中分离出来,通过板杂交分析。板孔中预包被上与探针互补的特异序列,捕获的DNA探针进一步用链酶亲和素-HRP检测,化学发光检测仪测定发光强度(RLUs)。